수의 마이크로바이옴 포럼
창립 세션兽医微生物组论坛
成立会议Veterinary Microbiome Forum
Launch Session

수의학에서의 마이크로바이옴: 중요성과 활용微生物组在兽医学中的意义与应用The Microbiome in Veterinary Medicine: Importance and Application

윤화영 교수 (서울대학교 수의과대학 명예교수)Hwa-Young Youn 教授（首尔大学兽医学院 名誉教授）Prof. Hwa-Young Youn (Professor Emeritus, College of Veterinary Medicine, Seoul National University)

윤 교수는 약물만으로는 해결되지 않던 소화기 질환의 임상 경험에서 마이크로바이옴에 대한 관심이 시작되었다고 밝혔다. 그는 장염 치료의 패러다임 전환을 설명했다. 과거에는 항생제가 중심이었으나 이제는 장내 미생물총의 회복으로 초점이 옮겨졌으며, 프로바이오틱스의 사용이 늘고 만성 장병증에 대한 객관적 질병 지수가 도입되었다. 파보바이러스성 장염과 같은 난치성 질환에서도 마이크로바이옴 조절이 의미를 갖기 시작하고 있다.尹教授谈到，他对微生物组的关注，源于那些仅靠药物无法解决的消化道病例的临床经验。他阐述了肠炎治疗的范式转变：过去以抗生素为中心，如今重心已转向肠道菌群的恢复——益生菌的使用日益普及，针对慢性肠病的客观疾病指数也已引入。即便在细小病毒性肠炎这类难治性疾病中，调节微生物组也开始显现出临床意义。Prof. Youn traced his interest in the microbiome to clinical experience with digestive cases that could not be resolved with medication alone. He described a paradigm shift in the treatment of enteritis: where antibiotics were once central, the focus has moved to restoring the gut microbiota, with growing use of probiotics and the introduction of objective disease indices for chronic enteropathy. Microbiome modulation is becoming relevant even in refractory conditions such as parvoviral enteritis.

그는 장–뇌–피부 축을 강조하며 개의 불안, 불면, 아토피 피부염을 장내 미생물과 연결한 2025년 연구를 인용했고, 신체 면역세포의 약 70%가 장에 존재하므로 장 면역이 건강의 핵심 결정 요인임을 역설했다. 반려동물의 수명이 길어지면서 노화 관련 만성질환 억제를 위한 장내 미생물의 항산화 활성 또한 중요해지고 있다.他强调了肠—脑—皮肤轴，并引用了2025年一项将犬的焦虑、失眠与特应性皮炎同肠道菌群相联系的研究；由于体内约70%的免疫细胞位于肠道，肠道免疫是健康的关键决定因素。随着伴侣动物寿命延长，肠道菌群的抗氧化活性对于抑制衰老相关慢性病也日益重要。He highlighted the gut–brain–skin axis, citing 2025 research linking canine anxiety, insomnia, and atopic dermatitis to gut microbes, and emphasized that roughly 70% of the body's immune cells reside in the gut, making gut immunity a central determinant of health. As companion animals live longer, the antioxidant activity of gut microbes also matters for suppressing aging-related chronic disease.

그는 마이크로바이옴 치료법을 상호 보완적인 네 가지 접근으로 정리했다 — 프리바이오틱스(이눌린, 펙틴 등 단쇄지방산을 생성하는 섬유질), 프로바이오틱스(효과가 종·균주 특이적인 살아있는 유익균), 포스트바이오틱스(사균체와 대사산물로, 뇌질환·아토피 등에서 활발히 제품화), 그리고 분변 미생물총 이식(생태계 자체의 복원). 이들은 개별 환자에 맞게 조합되어야 하며(예: 신바이오틱스), 개에는 개 유래, 고양이에는 고양이 유래의 종 특이적 균주가 선호된다. 핵심 프레임워크로 그는 '마이크로바이옴 팩토리(Microbiome Factory)' 개념을 제시했다. 장내 마이크로바이옴이 생산하는 생리활성 대사산물이 혈관계와 림프계를 건강하게 유지하여 산소·영양 공급, 면역세포 이동, 장기 항상성을 뒷받침하고 궁극적으로 건강한 장수를 촉진하며, 그 핵심 요소는 면역 조절이라는 것이다.他将微生物组疗法归纳为四种互补路径——益生元（菊粉、果胶等可产生短链脂肪酸的膳食纤维）、益生菌（效果具有种属与菌株特异性的活性有益菌）、后生元（灭活菌体与代谢产物，在脑部疾病、特应性皮炎等领域正被积极产品化），以及粪菌移植（直接重建生态系统本身）。这些手段应针对具体个体加以组合（如合生元），并优先选择种属特异性菌株——犬用犬源、猫用猫源。作为核心框架，他提出了“微生物组工厂（Microbiome Factory）”的概念：肠道微生物组产生的生物活性代谢产物维持血管与淋巴系统的健康，支撑氧气与营养输送、免疫细胞迁移及器官稳态，最终促进健康长寿，而其中的关键要素是免疫调节。He organized microbiome therapeutics into four complementary approaches — prebiotics (fibers such as inulin and pectin that yield short-chain fatty acids), probiotics (live beneficial organisms whose effects are species- and strain-dependent), postbiotics (inactivated cells and metabolites, actively commercialized for applications including brain disease and atopy), and fecal microbiota transplantation (restoring the ecosystem itself). These should be combined to fit the individual patient (e.g., synbiotics), and species-specific strains — canine-derived for dogs, feline-derived for cats — are preferred. As his core framework he presented the "Microbiome Factory" concept: bioactive metabolites produced by the gut microbiome keep vascular and lymphatic systems healthy, supporting oxygen and nutrient delivery, immune-cell trafficking, and organ homeostasis, ultimately promoting healthy longevity, with immune modulation as the key element.

그는 시판 프로바이오틱스 제품 다수가 과학적 검증을 결여하고 있음을 지적하면서, 포럼의 사명을 현장의 목소리를 모으고, 근거 기반 데이터를 축적하며, 종 특이적 가이드라인을 확립하고, 개별화된 영양 처방을 표준으로 만드는 것으로 규정했다 — 한국 수의학을 이 분야의 글로벌 리더로 자리매김하겠다는 포부와 함께.他指出市售益生菌产品中有相当一部分缺乏科学验证，并将论坛的使命界定为：汇集临床一线的声音、积累循证数据、确立种属特异性指南，并使个体化营养处方成为标准——同时怀抱着让韩国兽医学成为该领域全球引领者的抱负。Noting that many marketed probiotic products lack scientific verification, he framed the Forum's mission as gathering voices from the field, accumulating evidence-based data, establishing species-specific guidelines, and making individualized nutritional prescription a standard — with the ambition of positioning Korean veterinary medicine as a global leader in the field.

차세대 인체 마이크로바이옴 연구: 멀티오믹스와 정밀의료新一代人体微生物组研究：多组学与精准医疗Next-Generation Human Microbiome Research: Multi-omics and Precision Medicine

이동우 교수 (연세대학교 생명공학과)Dong-Woo Lee 教授（延世大学 生物工程系）Prof. Dong-Woo Lee (Department of Biotechnology, Yonsei University)

이 교수는 약 25년 전 NGS 기술이 유전체 시대를 열었음을 개관하고, 지난 70년간 감염성 질환에서 대사·면역 질환으로 질병 양상이 바뀐 것은 인간 유전자가 아니라 환경과 공생 미생물의 변화 때문이라고 주장했다. 그는 홀로바이온트(holobiont) 개념을 소개했다. 인간을 단일 유기체가 아니라 미생물과 공존하는 하나의 생태계로 보아야 하며, 이것이 정밀의료의 전제라는 것이다. 개인 고유의 마이크로바이옴은 동일한 약물에 대한 반응 차이를 설명하는 핵심 요인이다.李教授回顾了约25年前二代测序技术开启基因组时代的历程，并提出：过去70年间疾病谱由感染性疾病转向代谢与免疫性疾病，原因并非人类基因发生了改变，而是环境与共生微生物的变化。他介绍了“全生物体（holobiont）”概念：人类不应被视为单一有机体，而应被视为与微生物共存的一个生态系统，这正是精准医疗的前提。个体特有的微生物组，是解释同一药物疗效差异的关键因素。Prof. Lee reviewed how NGS technology opened the genomic era roughly 25 years ago, and argued that the shift in disease patterns over the past 70 years — from infectious to metabolic and immune disease — reflects changes in environment and symbiotic microbes rather than in human genes. He introduced the holobiont concept: the human should be viewed not as a single organism but as an ecosystem coexisting with its microbes, a premise that underpins precision medicine. An individual's unique microbiome is a key factor explaining differential responses to the same drug.

마이크로바이옴은 모체로부터 전달된 미생물을 바탕으로 출생 후 약 3년 이내에 형성되며, 식이와 환경에 의해 좌우된다. 식이의 효과는 빠르다 — 단 4일간의 식단 변화로도 장내 군집이 크게 재편될 수 있으며('you are what you eat'), 원시 부족과 현대 도시인의 생태계는 뚜렷이 다르다.微生物组以母体传递的微生物为基础，在出生后约三年内形成，并受饮食与环境左右。饮食的影响非常迅速——仅四天的膳食改变就足以显著重塑肠道菌群（“you are what you eat”），原始部落与现代城市居民的肠道生态系统存在明显差异。The microbiome assembles within about three years of birth from maternally transmitted microbes, shaped by diet and environment. Diet exerts rapid effects — as little as four days of dietary change can substantially remodel the gut community ("you are what you eat") — and the ecosystems of primitive tribes and modern city dwellers differ markedly.

그는 인간 마이크로바이옴 프로젝트(2006년 출범, 약 1억 8천만 달러)를 평가했다. 1단계는 건강인의 기준 마이크로바이옴을 확립하고 신체 부위별 생태계를 밝혔으며, 2단계는 질환 코호트를 비교하여 염증성 장질환에서의 디스바이오시스를 기록했지만, 특정 원인균이나 기전을 규명하지 못한 채 종료되었다. 중등도–중증 또는 치료 불응성 궤양성 대장염에서는 기존 치료제와 최신 표적치료제조차 임상 관해율이 대체로 20–45% 수준에 머무르는데, 이것이 FMT(임상 관해 약 30–40%, 일부 연구에서 최대 약 60%)가 주목받는 이유다. 세브란스병원과의 공동연구에서 그의 연구팀은 FMT 후 궤양성 대장염 환자 28명을 6개월간 추적한 결과, 건강인과 환자의 차이는 특정 미생물의 유무가 아니라 미생물 생태 네트워크의 구조 자체 — 유기체들 사이에 형성되는 네트워크의 기능적 결핍 — 에 있다고 결론지었다. 그는 새로운 바이오마커와 치료 표적을 찾으려면 멀티오믹스 데이터(유전체, 전사체, 단백체, 대사체)와 AI를 결합한 전체 생태계 기능의 통합 분석이 필요하다고 제안했다.他评述了人类微生物组计划（2006年启动，投入约1.8亿美元）。第一阶段确立了健康人群的基准微生物组，并阐明了各身体部位的生态系统；第二阶段比较疾病队列，记录了炎症性肠病中的菌群失调，却在未能锁定特定致病菌或机制的情况下结束。在中重度或治疗无应答的溃疡性结肠炎中，即便是现有药物与最新靶向治疗，临床缓解率大多仍停留在20–45%，这正是粪菌移植（临床缓解率约30–40%，部分研究最高可达约60%）受到关注的原因。在与延世大学 Severance 医院的合作研究中，他的团队对28例接受粪菌移植的溃疡性结肠炎患者随访6个月，结论是：健康人与患者之间的差异并不在于某种特定微生物的有无，而在于微生物生态网络的结构本身——即各生物体之间所形成网络的功能性缺失。他提出，要寻找新的生物标志物与治疗靶点，必须把多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组、代谢组）与人工智能结合，对整个生态系统的功能进行整合分析。He assessed the Human Microbiome Project (launched 2006, ~$180M): phase 1 established reference microbiomes of healthy individuals and revealed site-specific ecosystems; phase 2 compared disease cohorts and documented dysbiosis in inflammatory bowel disease; but the project closed without identifying specific causative organisms or mechanisms. In moderate-to-severe or treatment-refractory ulcerative colitis, clinical remission rates with conventional and even newer targeted therapies generally remain in the 20–45% range, which is why FMT (clinical remission ~30–40%, up to ~60% in some studies) is drawing attention. In a collaboration with Severance Hospital, his group followed 28 UC patients for six months after FMT and concluded that healthy individuals and patients differ not in the presence or absence of particular microbes but in the structure of the microbial ecological network itself — a functional deficiency of the networks formed among organisms. He proposed that new biomarkers and therapeutic targets will require integrated analysis of whole-ecosystem function through multi-omics data (genome, transcriptome, proteome, metabolome) combined with AI.

반려동물 마이크로바이옴의 이해认识伴侣动物微生物组Understanding the Companion Animal Microbiome

정설령 대표 (한국반려동물영양연구소)Seol-Ryung Jung 代表（韩国伴侣动物营养研究所）Seol-Ryung Chung (CEO, Korea Pet Nutrition Institute)

정 대표는 기본기부터 짚었다. 체내 미생물 세포(약 38조 개)는 숙주 세포(약 30조 개, 그중 80–90%는 적혈구)보다 많고, 반려동물에서도 사람과 마찬가지로 대장에 가장 밀도 높은 군집이 존재하며, 장내 미생물의 99%는 단 5개의 문(phylum)에 속한다. 그녀는 과학적 근거가 균주(strain) 수준에서 확립된다는 점을 강조했다. 종(species) 수준의 표기는 효능 주장을 뒷받침하기에 불충분한 반면, 명확히 특정된 균주는 대개 정의된 지표에서의 변화가 문서화되어 있음을 의미한다.郑代表从基础讲起：体内微生物细胞（约38万亿个）多于宿主细胞（约30万亿个，其中80–90%为红细胞）；与人类一样，伴侣动物体内密度最高的菌群也位于大肠；肠道微生物的99%仅归属于5个门。她强调，科学证据是在菌株（strain）层面确立的——仅标注到种（species）不足以支撑功效主张，而明确标定的菌株通常意味着已有文献记录了其在既定指标上的变化。CEO Chung grounded the audience in fundamentals: microbial cells in the body (~38 trillion) outnumber host cells (~30 trillion, 80–90% of which are red blood cells); the large intestine harbors the densest community in companion animals as in humans; and 99% of gut microbes belong to only five phyla. She stressed that scientific evidence is established at the strain level — species-level labeling is insufficient to support efficacy claims, whereas a clearly specified strain usually indicates documented changes in defined endpoints.

프로바이오틱스 문헌을 검토하며 그녀는 대부분의 연구가 대리 지표(분변 상태, 유해균 감소, 면역 지표) 수준에 머물러 있다고 지적했다. 개별 연구는 약하지만, 거의 모든 연구가 개선이라는 같은 방향을 가리키는 일관성은 향후 임상적 이득에 대한 신중한 낙관을 뒷받침한다. 병원균도 다양성에 포함해 계산하는 섀넌 다양성 지수의 과잉 해석을 경계했으며, 이를 디스바이오시스 지수(Dysbiosis Index) 같은 도구와 결합하는 추세를 언급했다. 개에서는 Clostridium hiranonis가 1차 담즙산을 2차 담즙산으로 전환하는 데 핵심적이다. 그녀는 VSL#3 단독으로 스테로이드+메트로니다졸 병용요법에 필적하는 임상적·조직학적 개선을 달성한 개 IBD 연구를 소개하면서 그 쟁점(적은 표본 수, 메트로니다졸의 영향)도 함께 짚었고, 밀착연접(tight junction) 단백질 발현 증가를 보인 연구들도 언급했다. 고양이 연구는 더 약하고 지표 수준에 머무는 양상으로, 종간 차이를 부각한다.在梳理益生菌文献时，她指出多数研究仍停留在替代指标层面（粪便性状、有害菌减少、免疫指标）。单项研究的证据强度有限，但几乎所有研究都指向“改善”这一相同方向，这种一致性支持对未来临床获益持谨慎乐观的态度。她提醒不要过度解读把病原菌也计入多样性的香农多样性指数，并提到将其与菌群失调指数（Dysbiosis Index）等工具结合使用的趋势。在犬中，Clostridium hiranonis 对将初级胆汁酸转化为次级胆汁酸至关重要。她介绍了一项犬 IBD 研究：单用 VSL#3 即达到了与“类固醇+甲硝唑”联合方案相当的临床与组织学改善，同时也点出了该研究的争议（样本量小、甲硝唑的影响）；她还提及了显示紧密连接蛋白表达上调的研究。猫的研究证据更弱且多停留在指标层面，凸显了种间差异。Reviewing the probiotic literature, she observed that most studies remain at the level of surrogate indicators (fecal quality, reduction of harmful bacteria, immune markers). Individual studies are weak, but the consistency of direction — nearly all showing improvement — supports cautious optimism about future clinical benefit. She warned against over-reading the Shannon diversity index, which counts pathogens toward diversity, and noted the trend toward combining it with tools such as the Dysbiosis Index. In dogs, Clostridium hiranonis is pivotal for converting primary to secondary bile acids. She discussed a canine IBD study in which VSL#3 alone achieved clinical and histological improvement comparable to steroid-plus-metronidazole therapy — while flagging its contested points (small n, metronidazole effects) — and studies showing increased tight-junction protein expression. Feline studies show a weaker, more indicator-level pattern, underscoring species differences.

초가공식품(UPF) 프레임워크를 펫푸드에 적용하며, 그녀는 대부분의 건사료가 UPF 정의에 부합한다고 지적했다. 이는 편의성, 경제성, 영양 균형을 제공하는 펫푸드에 대한 비난이 아니지만, 가공 과정에서 기능성 영양소가 파괴되는 것은 사실이며, 이는 보충과 식이 다양성의 필요성을 뒷받침한다 — 건사료 단독 급여는 암, 만성 장염, 아토피의 높은 발생률과, 이른 시기의 식이 다양성은 낮은 아토피 발생률과 연관된다는 연구들이 있다. 마지막으로 품질·안전 문제를 제기했다. 시판 프로바이오틱스 25개 제품을 분석한 한 연구에서 표기 함량과 실제가 일치한 것은 단 2개였고, 제품에서 항생제 내성 유전자가 검출되기도 한다 — '항생제에 강한 프로바이오틱스'가 반드시 미덕은 아니라는 뜻이다.她将超加工食品（UPF）框架应用于宠物食品，指出多数干粮符合 UPF 的定义。这并非否定提供便利性、经济性与营养均衡的宠物食品，但加工过程破坏功能性营养素确属事实，这也支持了补充与膳食多样化的必要性——已有研究显示，单一干粮喂养与癌症、慢性肠炎、特应性皮炎的较高发生率相关，而幼年期的饮食多样性则与较低的特应性皮炎发生率相关。最后她提出了质量与安全问题：一项分析25款市售益生菌产品的研究中，仅有2款的实际含量与标注相符；产品中还检出过抗生素耐药基因——这意味着“耐抗生素的益生菌”未必是优点。Applying the ultra-processed food (UPF) framework to pet food, she noted that most kibble meets the UPF definition; this is not an indictment of pet food, which offers convenience, economy, and nutritional balance, but processing does destroy functional nutrients, which argues for supplementation and dietary diversity — studies associate kibble-only feeding with higher rates of cancer, chronic enteritis, and atopy, and early dietary variety with lower atopy incidence. Finally she raised quality and safety concerns: in one analysis of 25 commercial probiotic products, only two matched their labeled content, and antibiotic-resistance genes are sometimes detected in products — meaning "antibiotic-robust probiotics" are not necessarily a virtue.

디스바이오시스를 넘어: 개와 고양이의 미생물 발효超越菌群失调：犬与猫的微生物发酵Beyond Dysbiosis: Microbial Fermentation in Dogs and Cats

랜디 링골드(Randy Ringold) 박사 (미국 VDI Laboratory 설립자 & CTO)Randy Ringold 博士（美国 VDI Laboratory 创始人兼 CTO）Randy Ringold, PhD (Founder & CTO, VDI Laboratory, USA)

임상화학자(이후 IDEXX에 매각된 NT-proBNP 검사의 개발자)인 링골드 박사는 모든 동물이 고유한 '박테리아 마을(bacterial village)'을 지닌다는 전제로 강연을 열었다. 시골 개와 뉴욕 시내 개가 같은 마이크로바이옴을 가질 것으로 기대하는 것은 무리이며, 모든 동물을 이상화된 평균에 끼워 맞추는 것은 가치가 제한적이다. 마이크로바이옴은 식이와 환경을 직접 반영하고 — 흙을 먹는 개의 토양 유래균, 사냥하는 고양이의 설치류 유래균 — 환경 독소(제초제, 살충제, 중금속)는 이를 직접 교란한다. 장내 미생물의 정상 범위는 10–100배까지 변동할 수 있으므로 단순한 고/저 판정은 임상 판단의 근거로 부적절하다.作为临床化学家（其开发的 NT-proBNP 检测后被 IDEXX 收购），Ringold 博士以“每只动物都拥有独特的‘细菌村落（bacterial village）’”为前提展开报告。指望乡村的狗与纽约市区的狗拥有相同的微生物组并不现实，把所有动物套进一个理想化的平均值，价值也十分有限。微生物组直接反映饮食与环境——吃土的狗体内有土壤源细菌，捕猎的猫体内有啮齿类来源的细菌——而环境毒素（除草剂、杀虫剂、重金属）会直接扰乱它。肠道微生物的正常范围可波动10–100倍，因此简单的“偏高/偏低”判定不足以作为临床决策依据。Dr. Ringold, a clinical chemist (developer of the NT-proBNP test later sold to IDEXX), opened with the premise that every animal carries a unique "bacterial village": expecting a rural dog and a New York City dog to share a microbiome is unreasonable, and fitting all animals to an idealized average has limited value. The microbiome directly reflects diet and environment — soil organisms in dogs that eat dirt, rodent organisms in hunting cats — and environmental toxins (herbicides, pesticides, heavy metals) directly perturb it. Because normal ranges for gut organisms can vary 10- to 100-fold, simple high–low calls are a poor basis for clinical decisions.

그의 핵심 프레임워크는 발효 균형이었다. 누가 있는지 못지않게 마이크로바이옴이 무엇을 하는지가 중요하다. 섬유질의 당분해(saccharolytic) 발효는 유익한 단쇄지방산을 만들고, 단백분해(proteolytic) 발효는 정상적이지만 과도해지면 분지쇄지방산, 암모니아, 인돌을 생성한다. 건강은 단백분해 발효가 억제된 가운데 당분해 발효가 우세한 상태에 해당한다. 암 연관 디스바이오시스는 흔히 그 반대 양상을 보이고, 항암화학요법 자체가 디스바이오시스를 유발하는 독소로 작용할 수 있으며, 치료 전 장 상태는 생존율 및 면역관문억제제 반응과 상관관계를 보인다. ACVIM 합의 보고서를 인용하며 그는 IBD가 이제 생태계 질환이자 대사적 디스바이오시스로 규정되고, 식이가 1차 방어선, 섬유질이 핵심 도구, 프로바이오틱스는 보조 수단이라고 설명했다. 그는 생태계 전체를 이식하는 '슈퍼 프로바이오틱스'로서 FMT를 강력히 지지했다.他的核心框架是发酵平衡：微生物组“在做什么”与“有谁在”同样重要。膳食纤维的糖分解发酵产生有益的短链脂肪酸；蛋白分解发酵本属正常，但过度时会产生支链脂肪酸、氨与吲哚。健康状态对应于蛋白分解发酵受到抑制、糖分解发酵占优势。与癌症相关的菌群失调常呈现相反格局，化疗本身也可能作为诱发菌群失调的毒素发挥作用，而治疗前的肠道状态与生存率及免疫检查点抑制剂的应答相关。他援引 ACVIM 共识报告指出，IBD 如今被界定为生态系统疾病与代谢性菌群失调，饮食是第一道防线，膳食纤维是核心工具，益生菌则为辅助手段。他大力主张把粪菌移植视为移植整个生态系统的“超级益生菌”。His central framework was fermentation balance: what the microbiome does matters as much as who is there. Saccharolytic fermentation of fiber yields beneficial short-chain fatty acids; proteolytic fermentation is normal but, when excessive, produces branched-chain fatty acids, ammonia, and indoles. Health corresponds to saccharolytic dominance with proteolytic fermentation kept in check. Cancer-associated dysbiosis often shows the reverse pattern, chemotherapy itself can act as a toxin inducing dysbiosis, and pre-treatment gut status correlates with survival and with response to immune checkpoint inhibitors. Citing the ACVIM consensus report, he noted that IBD is now framed as an ecosystem disease and metabolic dysbiosis, with diet as the first line of defense, fiber as the key tool, and probiotics as adjuncts. He strongly endorsed FMT as a "super-probiotic" that transplants an entire ecosystem.

그는 VDI의 방법론을 소개했다. 세균, 진균, 효모, 기생충, 항생제 내성 유전자까지 포괄하는 샷건 메타지노믹스; 상재균, 기회감염균, 병원균, 진균 범주 전반에 걸쳐 생태계 전체를 평가하는 '장 거시경제학(gut macroeconomics)' 접근; 발효 균형을 요약하는 발효 품질 지수(FQI, 고양이의 육식성 생리에 맞게 보정); 그리고 687마리의 개에서 위장관 증상 유무를 구분하는 데 ROC AUC 0.845를 달성한 디스바이오시스 중증도 지수(Dysbiosis Severity Index)가 그것으로, 이는 구체적 조치(프로바이오틱스, FMT, 식이 변경, 항생제)를 권고하는 근거 기반 모델에 반영된다.他介绍了 VDI 的方法学：涵盖细菌、真菌、酵母、寄生虫乃至抗生素耐药基因的鸟枪法宏基因组测序；跨常驻菌、条件致病菌、病原菌与真菌各类别评估整个生态系统的“肠道宏观经济学（gut macroeconomics）”方法；概括发酵平衡的发酵质量指数（FQI，并针对猫的肉食性生理作了校正）；以及在687只犬中区分有无胃肠道症状达到 ROC AUC 0.845 的菌群失调严重度指数（Dysbiosis Severity Index）——这些都被纳入可给出具体处置建议（益生菌、粪菌移植、更换饮食、抗生素）的循证模型。He introduced VDI's methodology: shotgun metagenomics covering bacteria, fungi, yeast, parasites, and antibiotic-resistance genes; a "gut macroeconomics" approach that evaluates the whole ecosystem across commensal, opportunistic, pathogenic, and fungal categories; a Fermentation Quality Index (FQI) summarizing fermentation balance (adjusted for the carnivorous physiology of cats); and a Dysbiosis Severity Index that achieved an ROC AUC of 0.845 in 687 dogs for separating animals with and without GI signs, feeding an evidence-based model that recommends concrete actions (probiotics, FMT, diet change, antibiotics).

세 가지 증례가 '식이가 먼저'라는 그의 지론을 보여주었다("식이를 통제하지 않을 거라면 프로바이오틱스나 FMT는 생각도 하지 마라"). 1년간 메트로니다졸과 프로바이오틱스를 복용했음에도 마이크로바이옴의 77%가 프로바이오틱스 균주이고 FQI가 매우 낮았던 불도그(프로바이오틱스 중단, 식이 변경, 다양성 회복을 위한 FMT로 치료); 무기력과 구토를 보인 12세 셸티에서 시퀀싱으로 밝혀낸 내산성 위 병원균 Sarcina (Clostridium) ventriculi; 그리고 급성 설사를 보인 생식 급여 버니두들에서 효모 9%(정상 <2%), Clostridium perfringens 29%, 토끼 배설물에서 유래한 것으로 추적된 Cyniclomyces guttulatus 9%가 확인된 사례가 그것이다 — 오염원을 제거하지 않은 치료는 일시적일 뿐이므로, 수의사는 오염원을 밝혀내는 탐정이 되어야 한다고 그는 강조했다.三个病例印证了他“饮食优先”的主张（“如果你不打算控制饮食，就别去想益生菌或粪菌移植”）：一只斗牛犬服用甲硝唑与益生菌长达一年，微生物组中77%仍为益生菌菌株且 FQI 极低（处置为停用益生菌、更换饮食，并以粪菌移植恢复多样性）；一只出现嗜睡与呕吐的12岁喜乐蒂牧羊犬，经测序发现耐酸性胃部病原菌 Sarcina (Clostridium) ventriculi；以及一只急性腹泻的生食喂养伯恩贵宾犬，检出真菌9%（正常<2%）、Clostridium perfringens 29%，以及被追溯到兔粪来源的 Cyniclomyces guttulatus 9%——他强调，不清除污染源的治疗只是暂时的，兽医必须成为查明污染源的侦探。Three cases illustrated his refrain that diet comes first ("if you are not going to control the diet, don't even think about probiotics or FMT"): a bulldog on a year of metronidazole and probiotics whose microbiome was 77% probiotic strains with a very low FQI (treated by stopping probiotics, changing diet, and FMT to restore diversity); a 12-year-old Sheltie with lethargy and vomiting in whom sequencing revealed the acid-resistant gastric pathogen Sarcina (Clostridium) ventriculi; and a raw-fed Bernedoodle with acute diarrhea showing 9% yeast (normal <2%), 29% Clostridium perfringens, and 9% Cyniclomyces guttulatus traced to rabbit droppings — the veterinarian, he argued, must act as a detective identifying the contamination source, since treatment without source removal is only temporary.